شرکت مهندسی آب و فاضلاب کشور در سال۱۳۷۱ در هیئت دولت به تصویب رسید و بر اساس پیشنهاد وزارت نیرو، اساسنامه مادر تخصصی شرکت مهندسی آب و فاضلاب کشور به تایید سازمان مدیر یت و وزارت امور اقتصادی رسید. هدف از تشکیل این سازمان ساماندهی فعالیتهای تصدی وزارت نیرو در امور آب و فاضلاب است.